Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHYHD1Q5SRE7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms