Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDRD12Q587J7 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms