Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLHL22Q53GT1 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL22Q53GT1 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms