Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMEM259Q4ZIN3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms