Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP28Q4G0W2 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP28Q4G0W2 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP28Q4G0W2 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP28Q4G0W2 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP28Q4G0W2 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP28Q4G0W2 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP28Q4G0W2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP28Q4G0W2 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP28Q4G0W2 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP28Q4G0W2 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP28Q4G0W2 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP28Q4G0W2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP28Q4G0W2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP28Q4G0W2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP28Q4G0W2 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP28Q4G0W2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP28Q4G0W2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
DUSP28Q4G0W2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP28Q4G0W2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP28Q4G0W2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP28Q4G0W2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP28Q4G0W2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP28Q4G0W2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP28Q4G0W2 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP28Q4G0W2 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP28Q4G0W2 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP28Q4G0W2 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP28Q4G0W2 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP28Q4G0W2 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP28Q4G0W2 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP28Q4G0W2 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP28Q4G0W2 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP28Q4G0W2 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP28Q4G0W2 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP28Q4G0W2 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP28Q4G0W2 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP28Q4G0W2 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP28Q4G0W2 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP28Q4G0W2 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP28Q4G0W2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP28Q4G0W2 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP28Q4G0W2 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP28Q4G0W2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DUSP28Q4G0W2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms