Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms