Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ODF4Q2M2E3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms