Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM187BQ17R55 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms