Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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RTN1Q16799 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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RTN1Q16799 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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RTN1Q16799 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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RTN1Q16799 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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RTN1Q16799 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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RTN1Q16799 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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RTN1Q16799 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RTN1Q16799 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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