Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF239Q16600 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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