Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIK4Q16099 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms