Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CHRNA6Q15825 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHRNA6Q15825 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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