Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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