Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms