Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIN2CQ14957 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIN2CQ14957 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIN2CQ14957 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIN2CQ14957 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIN2CQ14957 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIN2CQ14957 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIN2CQ14957 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIN2CQ14957 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIN2CQ14957 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIN2CQ14957 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIN2CQ14957 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIN2CQ14957 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIN2CQ14957 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIN2CQ14957 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIN2CQ14957 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIN2CQ14957 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIN2CQ14957 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIN2CQ14957 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIN2CQ14957 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIN2CQ14957 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIN2CQ14957 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIN2CQ14957 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIN2CQ14957 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIN2CQ14957 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIN2CQ14957 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIN2CQ14957 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIN2CQ14957 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIN2CQ14957 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIN2CQ14957 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIN2CQ14957 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIN2CQ14957 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIN2CQ14957 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIN2CQ14957 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIN2CQ14957 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIN2CQ14957 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIN2CQ14957 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIN2CQ14957 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIN2CQ14957 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIN2CQ14957 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIN2CQ14957 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIN2CQ14957 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIN2CQ14957 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIN2CQ14957 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIN2CQ14957 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GRIN2CQ14957 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GRIN2CQ14957 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms