Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BECN1Q14457 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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