Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PKP1Q13835 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PKP1Q13835 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms