Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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PMS2P11Q13670 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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PMS2P11Q13670 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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PMS2P11Q13670 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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PMS2P11Q13670 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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PMS2P11Q13670 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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PMS2P11Q13670 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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PMS2P11Q13670 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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PMS2P11Q13670 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PMS2P11Q13670 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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