Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATMQ13315 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATMQ13315 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATMQ13315 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATMQ13315 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATMQ13315 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATMQ13315 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATMQ13315 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATMQ13315 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATMQ13315 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATMQ13315 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATMQ13315 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATMQ13315 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATMQ13315 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATMQ13315 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATMQ13315 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATMQ13315 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATMQ13315 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATMQ13315 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATMQ13315 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATMQ13315 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATMQ13315 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATMQ13315 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATMQ13315 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATMQ13315 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATMQ13315 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATMQ13315 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATMQ13315 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATMQ13315 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATMQ13315 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATMQ13315 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATMQ13315 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATMQ13315 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATMQ13315 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATMQ13315 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATMQ13315 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATMQ13315 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATMQ13315 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATMQ13315 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATMQ13315 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATMQ13315 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATMQ13315 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATMQ13315 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATMQ13315 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATMQ13315 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATMQ13315 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATMQ13315 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATMQ13315 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATMQ13315 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATMQ13315 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATMQ13315 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATMQ13315 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATMQ13315 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATMQ13315 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATMQ13315 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATMQ13315 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATMQ13315 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATMQ13315 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATMQ13315 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATMQ13315 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATMQ13315 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATMQ13315 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATMQ13315 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATMQ13315 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATMQ13315 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATMQ13315 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATMQ13315 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATMQ13315 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATMQ13315 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATMQ13315 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATMQ13315 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATMQ13315 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATMQ13315 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATMQ13315 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATMQ13315 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATMQ13315 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATMQ13315 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATMQ13315 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATMQ13315 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATMQ13315 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATMQ13315 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATMQ13315 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATMQ13315 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATMQ13315 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATMQ13315 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATMQ13315 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATMQ13315 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATMQ13315 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATMQ13315 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATMQ13315 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATMQ13315 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATMQ13315 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATMQ13315 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATMQ13315 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ATMQ13315 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATMQ13315 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATMQ13315 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATMQ13315 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATMQ13315 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATMQ13315 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
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