Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CHAF1AQ13111 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
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