Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC10A2Q12908 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms