Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
STX4Q12846 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STX4Q12846 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
STX4Q12846 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STX4Q12846 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STX4Q12846 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STX4Q12846 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STX4Q12846 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STX4Q12846 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STX4Q12846 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STX4Q12846 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STX4Q12846 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
STX4Q12846 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
STX4Q12846 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STX4Q12846 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STX4Q12846 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STX4Q12846 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STX4Q12846 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STX4Q12846 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STX4Q12846 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STX4Q12846 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STX4Q12846 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STX4Q12846 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
STX4Q12846 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STX4Q12846 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
STX4Q12846 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
STX4Q12846 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
STX4Q12846 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
STX4Q12846 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
STX4Q12846 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
STX4Q12846 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
STX4Q12846 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
STX4Q12846 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
STX4Q12846 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
STX4Q12846 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
STX4Q12846 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
STX4Q12846 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
STX4Q12846 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
STX4Q12846 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
STX4Q12846 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
STX4Q12846 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
STX4Q12846 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
STX4Q12846 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
STX4Q12846 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
STX4Q12846 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
STX4Q12846 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
STX4Q12846 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
STX4Q12846 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
STX4Q12846 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
STX4Q12846 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
STX4Q12846 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
STX4Q12846 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
STX4Q12846 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
STX4Q12846 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
STX4Q12846 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
STX4Q12846 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
STX4Q12846 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
STX4Q12846 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
STX4Q12846 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
STX4Q12846 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
STX4Q12846 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
STX4Q12846 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
STX4Q12846 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
STX4Q12846 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
STX4Q12846 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
STX4Q12846 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
STX4Q12846 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
STX4Q12846 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
STX4Q12846 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
STX4Q12846 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
STX4Q12846 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
STX4Q12846 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
STX4Q12846 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
STX4Q12846 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
STX4Q12846 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
STX4Q12846 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
STX4Q12846 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
STX4Q12846 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
STX4Q12846 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
STX4Q12846 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
STX4Q12846 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
STX4Q12846 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
STX4Q12846 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
STX4Q12846 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
STX4Q12846 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
STX4Q12846 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
STX4Q12846 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
STX4Q12846 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
STX4Q12846 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
STX4Q12846 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
STX4Q12846 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
STX4Q12846 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
STX4Q12846 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
STX4Q12846 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
STX4Q12846 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
STX4Q12846 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
STX4Q12846 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
STX4Q12846 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
STX4Q12846 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
STX4Q12846 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms