Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
C2orf54Q08AI8 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C2orf54Q08AI8 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms