Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTDSPL2Q05D32 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms