Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF85Q03923 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms