Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms