Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSG1Q02413 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms