Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XPCQ01831 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XPCQ01831 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XPCQ01831 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XPCQ01831 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XPCQ01831 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XPCQ01831 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XPCQ01831 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XPCQ01831 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XPCQ01831 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XPCQ01831 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XPCQ01831 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XPCQ01831 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XPCQ01831 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XPCQ01831 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XPCQ01831 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XPCQ01831 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XPCQ01831 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XPCQ01831 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XPCQ01831 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XPCQ01831 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
XPCQ01831 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XPCQ01831 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
XPCQ01831 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XPCQ01831 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XPCQ01831 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XPCQ01831 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XPCQ01831 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XPCQ01831 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XPCQ01831 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XPCQ01831 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
XPCQ01831 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XPCQ01831 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XPCQ01831 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XPCQ01831 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XPCQ01831 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
XPCQ01831 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XPCQ01831 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
XPCQ01831 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XPCQ01831 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XPCQ01831 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
XPCQ01831 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
XPCQ01831 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
XPCQ01831 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XPCQ01831 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XPCQ01831 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XPCQ01831 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XPCQ01831 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XPCQ01831 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XPCQ01831 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XPCQ01831 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XPCQ01831 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
XPCQ01831 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
XPCQ01831 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XPCQ01831 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XPCQ01831 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XPCQ01831 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XPCQ01831 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XPCQ01831 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
XPCQ01831 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XPCQ01831 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XPCQ01831 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
XPCQ01831 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XPCQ01831 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XPCQ01831 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XPCQ01831 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XPCQ01831 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XPCQ01831 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
XPCQ01831 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
XPCQ01831 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
XPCQ01831 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XPCQ01831 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XPCQ01831 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XPCQ01831 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XPCQ01831 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XPCQ01831 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XPCQ01831 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XPCQ01831 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XPCQ01831 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XPCQ01831 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XPCQ01831 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XPCQ01831 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XPCQ01831 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
XPCQ01831 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XPCQ01831 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XPCQ01831 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
XPCQ01831 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XPCQ01831 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XPCQ01831 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XPCQ01831 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XPCQ01831 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
XPCQ01831 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
XPCQ01831 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XPCQ01831 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
XPCQ01831 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
XPCQ01831 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XPCQ01831 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XPCQ01831 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
XPCQ01831 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
XPCQ01831 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms