Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A2Q01362 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms