Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGD1P98174 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGD1P98174 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGD1P98174 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGD1P98174 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGD1P98174 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGD1P98174 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGD1P98174 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGD1P98174 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGD1P98174 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGD1P98174 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGD1P98174 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGD1P98174 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGD1P98174 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGD1P98174 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGD1P98174 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGD1P98174 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FGD1P98174 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGD1P98174 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGD1P98174 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGD1P98174 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGD1P98174 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGD1P98174 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGD1P98174 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGD1P98174 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FGD1P98174 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGD1P98174 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FGD1P98174 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FGD1P98174 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGD1P98174 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FGD1P98174 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGD1P98174 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGD1P98174 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGD1P98174 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGD1P98174 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGD1P98174 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGD1P98174 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGD1P98174 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGD1P98174 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGD1P98174 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGD1P98174 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD1P98174 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD1P98174 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD1P98174 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD1P98174 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD1P98174 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD1P98174 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD1P98174 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD1P98174 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD1P98174 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD1P98174 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD1P98174 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD1P98174 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD1P98174 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD1P98174 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD1P98174 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD1P98174 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD1P98174 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD1P98174 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD1P98174 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD1P98174 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD1P98174 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD1P98174 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD1P98174 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD1P98174 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD1P98174 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD1P98174 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD1P98174 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD1P98174 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD1P98174 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD1P98174 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD1P98174 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD1P98174 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD1P98174 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD1P98174 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD1P98174 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD1P98174 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGD1P98174 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FGD1P98174 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FGD1P98174 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FGD1P98174 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FGD1P98174 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FGD1P98174 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FGD1P98174 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FGD1P98174 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FGD1P98174 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FGD1P98174 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FGD1P98174 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FGD1P98174 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FGD1P98174 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FGD1P98174 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FGD1P98174 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FGD1P98174 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FGD1P98174 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FGD1P98174 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FGD1P98174 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FGD1P98174 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FGD1P98174 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FGD1P98174 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FGD1P98174 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms