Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM3BP58499 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms