Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBX2P52951 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBX2P52951 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBX2P52951 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBX2P52951 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBX2P52951 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBX2P52951 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBX2P52951 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GBX2P52951 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GBX2P52951 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBX2P52951 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBX2P52951 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBX2P52951 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBX2P52951 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBX2P52951 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GBX2P52951 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBX2P52951 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBX2P52951 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBX2P52951 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBX2P52951 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBX2P52951 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GBX2P52951 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBX2P52951 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GBX2P52951 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBX2P52951 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBX2P52951 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBX2P52951 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBX2P52951 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBX2P52951 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBX2P52951 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBX2P52951 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBX2P52951 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBX2P52951 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GBX2P52951 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX2P52951 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX2P52951 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX2P52951 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX2P52951 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX2P52951 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX2P52951 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX2P52951 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX2P52951 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX2P52951 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX2P52951 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX2P52951 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX2P52951 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX2P52951 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX2P52951 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX2P52951 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX2P52951 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX2P52951 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX2P52951 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX2P52951 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX2P52951 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX2P52951 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX2P52951 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX2P52951 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX2P52951 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX2P52951 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX2P52951 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX2P52951 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX2P52951 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX2P52951 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX2P52951 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX2P52951 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX2P52951 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX2P52951 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX2P52951 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX2P52951 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX2P52951 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX2P52951 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX2P52951 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX2P52951 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX2P52951 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX2P52951 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX2P52951 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX2P52951 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GBX2P52951 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX2P52951 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX2P52951 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX2P52951 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX2P52951 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX2P52951 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX2P52951 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX2P52951 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX2P52951 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX2P52951 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX2P52951 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX2P52951 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX2P52951 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX2P52951 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX2P52951 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX2P52951 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX2P52951 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX2P52951 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX2P52951 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX2P52951 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX2P52951 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX2P52951 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GBX2P52951 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms