Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCR4P51679 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCR4P51679 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCR4P51679 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCR4P51679 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCR4P51679 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCR4P51679 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCR4P51679 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCR4P51679 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCR4P51679 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCR4P51679 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCR4P51679 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCR4P51679 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCR4P51679 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCR4P51679 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCR4P51679 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCR4P51679 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCR4P51679 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCR4P51679 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCR4P51679 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCR4P51679 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCR4P51679 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCR4P51679 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCR4P51679 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCR4P51679 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCR4P51679 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCR4P51679 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCR4P51679 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCR4P51679 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCR4P51679 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCR4P51679 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCR4P51679 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCR4P51679 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCR4P51679 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCR4P51679 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCR4P51679 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCR4P51679 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCR4P51679 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCR4P51679 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCR4P51679 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCR4P51679 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCR4P51679 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCR4P51679 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCR4P51679 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCR4P51679 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCR4P51679 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCR4P51679 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCR4P51679 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCR4P51679 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCR4P51679 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCR4P51679 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCR4P51679 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCR4P51679 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCR4P51679 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCR4P51679 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCR4P51679 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCR4P51679 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCR4P51679 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCR4P51679 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCR4P51679 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCR4P51679 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCR4P51679 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCR4P51679 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR4P51679 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR4P51679 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR4P51679 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR4P51679 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR4P51679 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR4P51679 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR4P51679 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR4P51679 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR4P51679 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR4P51679 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR4P51679 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR4P51679 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR4P51679 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR4P51679 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR4P51679 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR4P51679 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR4P51679 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR4P51679 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR4P51679 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR4P51679 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR4P51679 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR4P51679 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR4P51679 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR4P51679 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR4P51679 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR4P51679 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR4P51679 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR4P51679 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR4P51679 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR4P51679 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR4P51679 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR4P51679 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR4P51679 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR4P51679 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR4P51679 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR4P51679 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCR4P51679 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms