Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPC3P51654 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPC3P51654 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPC3P51654 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPC3P51654 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPC3P51654 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPC3P51654 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPC3P51654 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPC3P51654 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPC3P51654 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPC3P51654 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPC3P51654 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPC3P51654 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPC3P51654 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPC3P51654 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GPC3P51654 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPC3P51654 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPC3P51654 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPC3P51654 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPC3P51654 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPC3P51654 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPC3P51654 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPC3P51654 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPC3P51654 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GPC3P51654 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC3P51654 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC3P51654 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC3P51654 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC3P51654 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC3P51654 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC3P51654 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC3P51654 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC3P51654 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC3P51654 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC3P51654 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC3P51654 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC3P51654 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC3P51654 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC3P51654 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC3P51654 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC3P51654 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC3P51654 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC3P51654 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC3P51654 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC3P51654 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC3P51654 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC3P51654 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC3P51654 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC3P51654 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC3P51654 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC3P51654 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC3P51654 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC3P51654 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC3P51654 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC3P51654 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC3P51654 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC3P51654 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC3P51654 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC3P51654 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC3P51654 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC3P51654 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GPC3P51654 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPC3P51654 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPC3P51654 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPC3P51654 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPC3P51654 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPC3P51654 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPC3P51654 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPC3P51654 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPC3P51654 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPC3P51654 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPC3P51654 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPC3P51654 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPC3P51654 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPC3P51654 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPC3P51654 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPC3P51654 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GPC3P51654 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPC3P51654 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPC3P51654 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPC3P51654 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPC3P51654 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPC3P51654 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPC3P51654 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPC3P51654 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPC3P51654 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPC3P51654 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPC3P51654 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPC3P51654 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPC3P51654 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPC3P51654 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC3P51654 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC3P51654 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC3P51654 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC3P51654 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC3P51654 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC3P51654 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC3P51654 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC3P51654 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPC3P51654 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms