Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SMARCA2P51531 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SMARCA2P51531 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SMARCA2P51531 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SMARCA2P51531 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SMARCA2P51531 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMARCA2P51531 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMARCA2P51531 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMARCA2P51531 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMARCA2P51531 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMARCA2P51531 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMARCA2P51531 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMARCA2P51531 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMARCA2P51531 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMARCA2P51531 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMARCA2P51531 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMARCA2P51531 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMARCA2P51531 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMARCA2P51531 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMARCA2P51531 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMARCA2P51531 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SMARCA2P51531 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMARCA2P51531 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMARCA2P51531 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMARCA2P51531 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMARCA2P51531 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMARCA2P51531 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMARCA2P51531 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMARCA2P51531 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMARCA2P51531 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SMARCA2P51531 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms