Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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RAB5CP51148 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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RAB5CP51148 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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RAB5CP51148 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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RAB5CP51148 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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