Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV1P50549 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV1P50549 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV1P50549 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV1P50549 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV1P50549 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ETV1P50549 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ETV1P50549 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ETV1P50549 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ETV1P50549 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ETV1P50549 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ETV1P50549 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ETV1P50549 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ETV1P50549 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ETV1P50549 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ETV1P50549 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ETV1P50549 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ETV1P50549 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ETV1P50549 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ETV1P50549 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ETV1P50549 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ETV1P50549 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ETV1P50549 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ETV1P50549 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ETV1P50549 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ETV1P50549 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ETV1P50549 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ETV1P50549 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ETV1P50549 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ETV1P50549 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ETV1P50549 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ETV1P50549 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ETV1P50549 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ETV1P50549 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ETV1P50549 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ETV1P50549 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ETV1P50549 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ETV1P50549 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ETV1P50549 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ETV1P50549 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ETV1P50549 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ETV1P50549 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ETV1P50549 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ETV1P50549 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ETV1P50549 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ETV1P50549 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ETV1P50549 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ETV1P50549 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ETV1P50549 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ETV1P50549 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ETV1P50549 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ETV1P50549 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ETV1P50549 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ETV1P50549 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ETV1P50549 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ETV1P50549 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ETV1P50549 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ETV1P50549 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ETV1P50549 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ETV1P50549 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ETV1P50549 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ETV1P50549 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ETV1P50549 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ETV1P50549 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ETV1P50549 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ETV1P50549 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ETV1P50549 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ETV1P50549 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ETV1P50549 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ETV1P50549 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ETV1P50549 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ETV1P50549 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ETV1P50549 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ETV1P50549 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ETV1P50549 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ETV1P50549 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ETV1P50549 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ETV1P50549 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ETV1P50549 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ETV1P50549 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ETV1P50549 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ETV1P50549 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ETV1P50549 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ETV1P50549 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ETV1P50549 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ETV1P50549 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ETV1P50549 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ETV1P50549 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ETV1P50549 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ETV1P50549 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ETV1P50549 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ETV1P50549 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ETV1P50549 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ETV1P50549 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ETV1P50549 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ETV1P50549 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ETV1P50549 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ETV1P50549 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ETV1P50549 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ETV1P50549 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms