Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT3P49368 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT3P49368 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT3P49368 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT3P49368 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT3P49368 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT3P49368 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT3P49368 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT3P49368 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT3P49368 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT3P49368 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT3P49368 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT3P49368 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT3P49368 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT3P49368 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT3P49368 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT3P49368 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT3P49368 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT3P49368 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT3P49368 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT3P49368 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT3P49368 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT3P49368 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT3P49368 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT3P49368 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT3P49368 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT3P49368 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT3P49368 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT3P49368 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT3P49368 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT3P49368 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT3P49368 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT3P49368 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT3P49368 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT3P49368 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT3P49368 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT3P49368 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT3P49368 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT3P49368 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT3P49368 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT3P49368 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT3P49368 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT3P49368 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT3P49368 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT3P49368 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT3P49368 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT3P49368 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT3P49368 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT3P49368 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT3P49368 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT3P49368 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT3P49368 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT3P49368 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT3P49368 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT3P49368 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT3P49368 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT3P49368 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT3P49368 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT3P49368 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT3P49368 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT3P49368 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT3P49368 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT3P49368 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT3P49368 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT3P49368 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT3P49368 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT3P49368 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT3P49368 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT3P49368 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT3P49368 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT3P49368 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT3P49368 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT3P49368 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT3P49368 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT3P49368 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT3P49368 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT3P49368 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT3P49368 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT3P49368 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT3P49368 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT3P49368 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT3P49368 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT3P49368 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT3P49368 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT3P49368 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT3P49368 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT3P49368 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT3P49368 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT3P49368 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT3P49368 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT3P49368 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT3P49368 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT3P49368 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT3P49368 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT3P49368 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT3P49368 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT3P49368 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT3P49368 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT3P49368 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT3P49368 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms