Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD52P43351 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD52P43351 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD52P43351 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD52P43351 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD52P43351 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD52P43351 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD52P43351 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD52P43351 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD52P43351 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD52P43351 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD52P43351 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD52P43351 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD52P43351 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD52P43351 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD52P43351 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD52P43351 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD52P43351 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD52P43351 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD52P43351 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD52P43351 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD52P43351 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD52P43351 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD52P43351 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD52P43351 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD52P43351 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD52P43351 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD52P43351 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD52P43351 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD52P43351 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD52P43351 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD52P43351 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD52P43351 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD52P43351 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD52P43351 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD52P43351 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD52P43351 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD52P43351 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD52P43351 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD52P43351 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD52P43351 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD52P43351 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD52P43351 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD52P43351 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD52P43351 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD52P43351 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD52P43351 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD52P43351 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD52P43351 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD52P43351 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD52P43351 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD52P43351 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD52P43351 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD52P43351 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD52P43351 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD52P43351 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD52P43351 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD52P43351 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD52P43351 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD52P43351 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD52P43351 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD52P43351 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD52P43351 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD52P43351 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD52P43351 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD52P43351 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD52P43351 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD52P43351 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD52P43351 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD52P43351 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD52P43351 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD52P43351 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD52P43351 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD52P43351 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD52P43351 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD52P43351 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD52P43351 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD52P43351 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD52P43351 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD52P43351 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD52P43351 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD52P43351 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD52P43351 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD52P43351 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD52P43351 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD52P43351 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD52P43351 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD52P43351 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD52P43351 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD52P43351 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD52P43351 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD52P43351 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD52P43351 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD52P43351 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD52P43351 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD52P43351 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD52P43351 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD52P43351 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD52P43351 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD52P43351 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms