Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC1P41238 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms