Protein–RNA interactions for Protein: P40222

TXLNA, Alpha-taxilin, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXLNAP40222 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TXLNAP40222 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TXLNAP40222 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TXLNAP40222 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TXLNAP40222 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TXLNAP40222 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TXLNAP40222 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TXLNAP40222 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TXLNAP40222 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TXLNAP40222 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TXLNAP40222 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TXLNAP40222 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TXLNAP40222 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TXLNAP40222 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TXLNAP40222 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TXLNAP40222 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TXLNAP40222 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TXLNAP40222 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TXLNAP40222 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TXLNAP40222 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TXLNAP40222 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TXLNAP40222 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TXLNAP40222 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TXLNAP40222 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TXLNAP40222 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TXLNAP40222 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TXLNAP40222 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TXLNAP40222 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TXLNAP40222 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TXLNAP40222 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TXLNAP40222 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TXLNAP40222 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TXLNAP40222 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TXLNAP40222 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TXLNAP40222 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TXLNAP40222 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TXLNAP40222 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TXLNAP40222 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TXLNAP40222 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TXLNAP40222 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TXLNAP40222 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TXLNAP40222 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TXLNAP40222 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TXLNAP40222 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TXLNAP40222 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TXLNAP40222 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TXLNAP40222 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TXLNAP40222 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TXLNAP40222 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TXLNAP40222 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TXLNAP40222 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TXLNAP40222 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TXLNAP40222 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TXLNAP40222 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TXLNAP40222 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TXLNAP40222 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TXLNAP40222 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TXLNAP40222 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TXLNAP40222 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TXLNAP40222 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TXLNAP40222 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TXLNAP40222 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TXLNAP40222 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TXLNAP40222 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TXLNAP40222 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TXLNAP40222 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TXLNAP40222 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TXLNAP40222 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TXLNAP40222 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TXLNAP40222 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TXLNAP40222 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TXLNAP40222 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TXLNAP40222 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TXLNAP40222 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TXLNAP40222 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TXLNAP40222 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TXLNAP40222 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TXLNAP40222 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TXLNAP40222 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TXLNAP40222 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TXLNAP40222 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TXLNAP40222 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TXLNAP40222 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TXLNAP40222 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TXLNAP40222 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TXLNAP40222 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TXLNAP40222 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TXLNAP40222 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TXLNAP40222 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TXLNAP40222 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TXLNAP40222 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TXLNAP40222 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TXLNAP40222 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TXLNAP40222 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TXLNAP40222 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TXLNAP40222 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TXLNAP40222 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TXLNAP40222 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TXLNAP40222 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TXLNAP40222 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms