Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM23P36406 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms