Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms