Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD13P35453 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms