Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RCVRNP35243 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms