Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC1P35052 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC1P35052 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC1P35052 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC1P35052 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC1P35052 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC1P35052 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC1P35052 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC1P35052 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC1P35052 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC1P35052 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC1P35052 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC1P35052 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC1P35052 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC1P35052 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC1P35052 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC1P35052 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC1P35052 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC1P35052 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC1P35052 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC1P35052 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC1P35052 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC1P35052 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC1P35052 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC1P35052 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC1P35052 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC1P35052 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC1P35052 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GPC1P35052 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC1P35052 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC1P35052 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC1P35052 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC1P35052 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC1P35052 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC1P35052 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC1P35052 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC1P35052 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC1P35052 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC1P35052 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC1P35052 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC1P35052 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC1P35052 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC1P35052 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC1P35052 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC1P35052 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC1P35052 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC1P35052 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC1P35052 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC1P35052 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC1P35052 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC1P35052 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC1P35052 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC1P35052 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC1P35052 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC1P35052 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC1P35052 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC1P35052 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC1P35052 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC1P35052 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC1P35052 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC1P35052 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPC1P35052 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
GPC1P35052 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GPC1P35052 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC1P35052 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC1P35052 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC1P35052 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC1P35052 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC1P35052 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC1P35052 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC1P35052 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC1P35052 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC1P35052 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC1P35052 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC1P35052 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC1P35052 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC1P35052 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC1P35052 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC1P35052 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC1P35052 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC1P35052 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC1P35052 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC1P35052 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC1P35052 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC1P35052 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC1P35052 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC1P35052 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC1P35052 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC1P35052 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC1P35052 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC1P35052 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC1P35052 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC1P35052 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC1P35052 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC1P35052 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC1P35052 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC1P35052 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC1P35052 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC1P35052 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GPC1P35052 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms