Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms