Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms