Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATP5DP30049 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms