Protein–RNA interactions for Protein: P28907

CD38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD38P28907 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD38P28907 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD38P28907 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD38P28907 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD38P28907 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD38P28907 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD38P28907 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD38P28907 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD38P28907 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD38P28907 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD38P28907 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD38P28907 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD38P28907 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD38P28907 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD38P28907 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD38P28907 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD38P28907 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD38P28907 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD38P28907 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD38P28907 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CD38P28907 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD38P28907 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CD38P28907 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD38P28907 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD38P28907 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD38P28907 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD38P28907 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD38P28907 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CD38P28907 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD38P28907 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CD38P28907 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD38P28907 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD38P28907 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD38P28907 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD38P28907 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD38P28907 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD38P28907 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD38P28907 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD38P28907 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD38P28907 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD38P28907 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CD38P28907 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD38P28907 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CD38P28907 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD38P28907 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD38P28907 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD38P28907 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD38P28907 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD38P28907 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD38P28907 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD38P28907 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD38P28907 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD38P28907 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD38P28907 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD38P28907 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD38P28907 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD38P28907 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD38P28907 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD38P28907 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD38P28907 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD38P28907 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CD38P28907 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD38P28907 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD38P28907 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CD38P28907 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD38P28907 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD38P28907 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD38P28907 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD38P28907 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD38P28907 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD38P28907 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD38P28907 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD38P28907 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CD38P28907 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD38P28907 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD38P28907 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CD38P28907 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD38P28907 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD38P28907 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD38P28907 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD38P28907 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CD38P28907 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD38P28907 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD38P28907 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD38P28907 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD38P28907 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD38P28907 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD38P28907 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD38P28907 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD38P28907 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD38P28907 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD38P28907 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CD38P28907 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD38P28907 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CD38P28907 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD38P28907 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD38P28907 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD38P28907 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD38P28907 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD38P28907 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms